乗車券のみで特急列車に乗車できる特例区間

JRの特急に乗車するには原則として特急券が必要ですが、いくつかの区間では特例で乗車券のみでの乗車が認められています。

会社	区間
JR北海道	新夕張～新得間
JR東日本	青森～新青森間
JR九州	早岐～佐世保間
JR九州	宮崎～宮崎空港間

しかしながらこれらの区間での特例乗車が認められているのは、普通車自由席に乗車する場合に限られています。では普通車指定席やグリーン車に乗車する場合の取扱はどのようになっているのでしょうか。